Eng nei Waff fir d'Diagnos vun Tuberkulos an d'Detektioun vu Medikamentenresistenz: Eng nei Generatioun vun Targeted Sequencing (tNGS) a Kombinatioun mat Maschinnléieren fir d'Diagnos vun Tuberkulos-Hypersensibilitéit
Literaturbericht: CCa: en diagnostescht Modell baséiert op tNGS a maschinellem Léieren, dat fir Leit mat manner bakterieller Tuberkulos a tuberkulöser Meningitis gëeegent ass.
Titel vun der Thees: Tuberkulos-gezielte Sequenzéierung vun der nächster Generatioun a maschinellt Léieren: eng ultrasensitiv Diagnosestrategie fir paucifiz Lungentubulären a tubulär Meningitis.
Zeitschrift: 《Clinica Chimica Acta》
WANN：6.5
Datum vun der Verëffentlechung: Januar 2024
Zesumme mat der University of Chinese Academy of Sciences an dem Beijing Chest Hospital vun der Capital Medical University huet Macro & Micro-Test en Tuberkulosdiagnosmodell entwéckelt, deen op der neier Generatioun vun der Targeted Sequenceing (tNGS) Technologie an der maschineller Léiermethod baséiert, déi eng ultra-héich Detektiounsempfindlechkeet fir Tuberkulos mat wéineg Bakterien an tuberkulöser Meningitis geliwwert huet, eng nei Hypersensibilitéitsdiagnosmethod fir d'klinesch Diagnos vun zwou Aarte vun Tuberkulos geliwwert huet, an déi präzis Diagnos, d'Detektioun vun der Medikamentenresistenz an d'Behandlung vun Tuberkulos gehollef huet. Gläichzäiteg gouf festgestallt, datt d'Plasma-cfDNA vum Patient als e passenden Prouftyp fir d'klinesch Proufnahme bei der Diagnos vun TBM benotzt ka ginn.
An dëser Studie goufen 227 Plasmaprouwen a Gehirnflëssegkeetsprouwen benotzt fir zwou klinesch Kohorten opzestellen, an deenen d'Laboratoire-Diagnos-Kohortprouwen benotzt goufen fir de maschinelle Léiermodell vun der Tuberkulosdiagnos ze etabléieren, an d'klinesch-diagnostesch Kohortprouwen benotzt goufen fir den etabléierte Diagnosemodell ze verifizéieren. All Prouwen goufen als éischt vun engem speziell entwéckelten, gezielte Capture-Probe-Pool fir Mycobacterium tuberculosis gezielt gezielt getest. Duerno, baséiert op TB-tNGS-Sequenzéierungsdaten, gëtt den Entscheedungsbammodell benotzt fir eng 5-fach Kräizvalidéierung op den Trainings- a Validéierungssets vun der Laboratoire-Diagnos-Warteschlaang duerchzeféieren, an d'Diagnoseschwellen vu Plasmaprouwen a Gehirnflëssegkeetsprouwen ginn kritt. De krittene Schwellwäert gëtt an zwou Testsets vun der klinescher Diagnos-Warteschlaang fir d'Detektioun zesummebruecht, an d'Diagnoseleeschtung vum Léierer gëtt mat der ROC-Kurve evaluéiert. Schlussendlech gouf den Diagnosemodell vun Tuberkulos kritt.
Fig. 1 schematescht Diagramm vum Fuerschungsdesign
Resultater: Geméiss de spezifesche Schwellenwäerter vun der CSF-DNA-Prouf (AUC = 0,974) a Plasma-cfDNA-Prouf (AUC = 0,908), déi an dëser Studie bestëmmt goufen, louch d'Sensibilitéit vun der CSF-Prouf bei 227 Proben bei 97,01%, d'Spezifizitéit bei 95,65% an d'Sensibilitéit an d'Spezifizitéit vun der Plasma-Prouf bei 82,61% an 86,36%. An der Analyse vu 44 gepaarte Proben aus Plasma-cfDNA an Zerebrospinalflëssegkeet-DNA vu Patienten mat TBM huet d'Diagnosestrategie vun dëser Studie eng héich Konsistenz vun 90,91% (40/44) a Plasma-cfDNA an Zerebrospinalflëssegkeet-DNA gewisen, an d'Sensibilitéit bei 95,45% (42/44). Bei Kanner mat pulmonaler Tuberkulos ass d'Diagnosestrategie vun dëser Studie méi sensibel fir Plasma-Prouwen wéi d'Xpert-Detektiounsresultater vu Magensaft-Prouwen vun de selwechte Patienten (28,57% VS 15,38%).
Fig. 2 Analyseleistung vum Tuberkulosdiagnosmodell fir Populatiounsstichproben
